一般大多数情况下，新生儿发烧是不会损伤大脑的，但是只有极个别的情况下，比如炎症反应强烈，很可能会引发大脑的受损。
一般新生儿出现发烧，大多数是由于感染因素所引起。比如病毒，细菌，支原体等感染，而引起的呼吸道的炎症。这个时候体温会出现持续升高的趋势。一般患者积极地被呵护和治疗，能够使体温逐渐降低，炎症消退，是不会使大脑受到损伤的。如果持续高热，可能会引发高热惊厥。一般情况下，也不会对大脑造成明显的损伤。通常可以选择退热剂，比如布洛芬，对酰氨基酚等积极的对应，炎症反应进行抗病原体的治疗。
但是，如果由于炎症反应比较强烈，新生儿发烧持续不退，很可能会引发中枢神经系统的感染，比如脑炎，脑膜炎等。这个时候如果持续没有规范的治疗，或者没有及时就诊，很可能会使脑部的炎症反应更加强烈，脑组织受损，从而损伤大脑。
