通常情况下，规范的短期内使用雾化治疗咳嗽，小儿不会出现副作用的。如果长期不规范的做雾化，小儿可能会出现一些副作用。
规范的雾化吸入可以有效的缓解咳嗽的症状，药物直接进入小儿的呼吸道，能够局部产生药物的作用，局部使病灶炎症反应减轻，这样就可以达到缓解咳嗽的目的。一般根据情况可以选择3到7天左右进行雾化，然后再根据情况间隔一段时间再做雾化，一般不会出现副作用。
但是如果频繁的做雾化，有可能会出现副作用，比如出现咽喉部的刺激反应，反而会引起刺激性的咳嗽加重，甚至一些药物长期使用，比如糖皮质激素，可能会造成咽部出现菌群失调，比如诱发真菌感染。
