疱疹性咽峡炎和手足口病的区别主要在于病因不同、并发症不同、症状不同等，平时应该注意个人卫生，勤洗手、勤洗澡。
1、病因不同：疱疹性咽峡炎是由柯萨奇病毒、埃可病毒引起，1-7岁的儿童更为常见，更具传染性。手足口病是由肠病毒引起，如柯萨奇病毒A16型和肠病毒71型，5岁以下的儿童常见，更具传染性。
2、并发症不同：疱疹性咽峡炎有可能会合并细菌感染，通常不会出现重症，不会并发脑炎。而手足口病有可能会合并脑炎、心肌炎等，对于重症的手足口病有可能会危及孩子的生命。
3、症状不同：疱疹性咽峡炎只发生在口腔黏膜，表现为咽峡部和舌部的疱疹和溃疡。手足口病的患者，除了口腔黏膜有疱疹之外，手脚等部位甚至臀部的皮肤也会出现疱疹，疱疹通常呈小米粒大小或者绿豆大小。
注意事项：
除上述常见区别外，还有其他区别，例如潜伏期不同、传播途径不同、治疗不同等，需引起重视。如果持续高热不退，同时病程超过3天，需及时前往医院小儿感染科就诊，完善血常规、血生化等相关检查，明确诊断后遵医嘱进行针对性治疗。
