从胚胎发育方面来讲，房间隔的形成是第一房间隔和第二房间隔，分别从相反的方向生长，最后会和连接而成。
房间隔缺损指的是在胚胎发育过程当中，房间隔的发生吸收和融合出现了异常，导致第一房间隔或者第二房间隔，没有生长完全，两个房间隔没有会合连接在一起，从而导致左心房和右心房之间残留缺损。
卵圆孔指的是第一第二房间隔生长混合以后，因为相互覆盖，而在两层房间隔之间形成的潜在性腔隙，如果出生以后，第一房间隔和第二房间隔没有能够粘连融合，就会形成卵圆孔未闭。
因此卵圆孔未闭，只能存在于心脏房间隔的卵圆窝部位，大小通常不超过5毫米，而房间隔缺损可以存在于包括卵圆窝在内的房间隔的任何部位，直径大小不等，往往会超过5毫米，可见卵圆孔未闭，可以算作是房间隔缺损的范畴，但是不属于先天性心脏病，也不需要手术处理，而大的房间隔缺损，往往需要手术处理。
