每一种先天性心脏病的特点，复杂程度，就诊是否及时等多种因素，决定先天性心脏病手术的效果和远期预后。举几个比较简单的例子：
多数简单类型的先天性心脏病，比如室间隔缺损、房间隔缺损、动脉导管未闭等等，如果患儿就诊及时早期得到手术矫治的话，基本上不会留有后遗症，手术后患儿可以完全的恢复正常，寿命跟正常人是一样。不过同样是这几种病，如果患儿就诊时机比较晚，肺动脉的高压已经十分严重情况下才来做手术，术后就会残留一定程度的肺动脉高压，而影响患儿完全恢复到正常的状态，这个时候寿命肯定是会受到影响，影响的大小由后遗症的轻重来决定。
另外还有一些复杂类型的疾病，比如肺动脉闭锁、三尖瓣闭锁等等，这类的疾病本身就无法进行根治，即使经过多次的手术，也只是缓解心脏病带来的症状，甚至每次手术都有生命风险，这类孩子体质健康和生活质量，终生都无法达到正常孩子的状态，因此这类先心病孩子的寿命就更加无法估测。
