室间隔缺损可以通过微创的方式达到治疗的目的，常见的微创方式有外科微创和介入微创封堵。
1、外科微创的方法是不采用传统切胸部正中切口，而是采用右侧腋下直或斜的小切口进胸，完成体外循环的建立和室间隔缺损的修补，这种切口的优势是不动胸骨或者肋骨，是从相邻的两个肋间隙进胸，因此创伤较小，术后患儿疼痛小、恢复快，还有就是斜口小，而且隐蔽，外形上比较美观。 外科微创的适用范围比较广，对所有部位的室间隔缺损都可以采用这种方法进行手术。
2、介入微创封堵，又可以分为外科小切口介入封堵和经导管介入封堵两种，介入微创封堵方法适用范围有限，对室间隔缺损的大小和部位有比较严格的要求，但是对于肌部室间隔缺损的治疗，却有外科手术比不了的优势。
