由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用的非处方药外，并在医生指导下充分结合个人情况，选择最适合的药物。
1、抗病毒药物。抗病毒药物可逆转肝纤维化和早期肝硬化。治疗待偿期乙肝肝硬化首选恩替卡韦、替诺福韦酯等药物，具有抗病毒强、耐药性低特点。此期的肝功能相对好的患者也可以选择干扰素进行治疗。
2、代偿期或是失代偿期的丙肝患者一般首选抗病毒药物治疗，如索磷布韦+达卡他韦等药物，且必须在有经验的医师指导下服用。
其他的药物，肝硬化的药物治疗还包括一些对症治疗以及并发症的治疗，例如有腹水的患者联合使用利尿剂，如螺内酯联合呋塞米，必要时可酌情配合输注清蛋白。有细菌感染时需要加用肝毒性小的抗生素的，综合治疗肝硬化所产生的并发症。
