心内膜垫缺损在临床上属于一种复杂的先天性心脏病，根据不同的分型，手术难易程度和手术以后恢复时间的不同，住院费用是不一样。
心内膜垫缺损当中相对比较简单的一型，是部分型心内膜垫缺损，这类畸形二尖瓣裂和二尖瓣的返流通常不严重，做手术成型和修补的效果通常比较好，远期的预后也比较好，恢复起来也比较快，因为住院时间短，所以住院费用也不会太高，基本上和室间隔缺损手术差不多，大概5万左右。
如果左右房室瓣畸形比较严重，心脏十字交叉消失的那一类完全性心脏病的缺损，那么就比较严重了，这类畸形手术的时候时间也比较长，手术步骤也比较复杂，在手术以后恢复起来也比较慢，而且住院时间长，所以费用相对来说比较高，费用大概是几万到十几万。
