新生儿卵圆孔未闭几乎是每个新生儿都存在的现象，理论上它属于生理性的，不会有太多的危害。
但在某些情况下，新生儿卵圆孔未闭会造成一些疾病的加重，最常见的是新生儿持续性肺动脉高压，英文叫做PPHN，这类病人是指由于患儿肺部肺动脉的压力持续增高，由于重症肺炎，或者新生儿呼吸窘迫综合征（RDS）等原因造成的肺动脉的压力持续增高，导致右心系统的压力远远超过左心系统的压力。
如果卵圆孔未闭导致右心的血通过卵圆孔流向左心，从而导致低含氧量的血流到体循环，出现全身的缺氧的表现，也就是氧饱和度下降的表现，在这种情况下需要对卵圆孔未闭做处理。
除PPHN的情况以外,其他的情况下都不需要进行特别的处理。正常生理情况下，新生儿卵圆孔未闭不会造成什么危害。
