大部分甲流患者一般在7-14天会痊愈，如果出现并发症，可能时间更长一些。
甲流是甲型H1N1病毒感染引起的，需要体内产生抗体，通过抗体把病毒清除，用药即使有缓解症状或抗病毒的作用，但是不能完全清除，最终痊愈要靠自身免疫力的提升或产生抗体，比如打过甲流疫苗的患者可以快速的产生抗体，把病毒清除，病程会稍微短一些。
如果患者体质弱、免疫力低，可能患病时间会长一些，可能在2周左右，大部分患者会好转，但有一部分患者，比如出现了比较重的并发症，病毒性肺炎患者可能会继发缺氧甚至呼衰，还有病毒性心肌炎也可能会造成心肌的损害，病程因人而异，比较重的患者病程要根据治疗的效果，以及自身免疫情况综合判断，有些人甚至可能会危及生命。
重症患者的疗程是不太确定的，大部分患者在一周到两周之内会痊愈。
