下肢静脉血栓最主要的并发症是在血栓急性期，血栓脱离原位，顺着血流飘到心脏，再经过心脏栓塞到肺动脉病，造成肺栓塞。
严重的肺栓塞可以导致患者猝死，一些比较大块的肺栓塞，会导致患者出现呼吸功能的异常，小块的肺拴塞大多是无症状，一些肺栓塞会引起胸痛、咳嗽、咳血。除了急性肺栓塞之外，在急性期严重的深静脉血栓，可以波及到浅静脉系统，导致下肢的深浅静脉同时受阻，在这种情况下肢的静脉局部回流不畅，导致整个下肢的静水压持续增高，严重的压力可以造成动脉的受压，由此导致下肢的缺血，外观的表现可以是青紫，也可以是苍白，因此又称为做股青肿或者股白肿，这种极端的情况，是有可能导致患者因为缺血而导致肢体的丢失，因此这是最主要的两个并发症。
深静脉血栓的后期，主要的并发症浅静脉的曲张和下肢的水肿，严重可以出现下肢的色素沉着和静脉性溃疡。
